Podmienkami pre absolvovanie predmetu Mikrobiológia v ZS je 100 % aktívna účasťna praktických cvičeniach z mikrobiológie a 2 písomné previerky (testy), s maximom získaných bodov 10/test. Kredit nebude udelený študentovi, ktorý z niektorej písomnej previerky (testu) dosiahne menej ako 5,5 bodov. Predmet končí skúškou pozostávajúcou z 2 častí: praktickej a písomnej. Hodnotenie: kreditové testy 10-20 %, praktická skúška 11-20 %, písomná časť 30-60 %.

V prípade potreby presunutia výučby do online priestoru prostredníctvom platformy MOODLE, môžu nastať zmeny v počte či charaktere otázok, ale základnou podmienkou je dosiahnuť minimálne 51 %.

Po absolvovaní predmetu Mikrobiológia študenti získajú teoretické a praktické vedomosti zo špeciálnej bakteriológie a virológie, s ohľadom na taxonomické zatriedenie, faktory patogenity infekčných agensov a patogenézu infekcií. Zároveň získajú prehľad o uplatnení vyšetrovacích metód akými sú mikroskopické, kultivačné, biochemické, sérologické a molekulovo-biologické vyšetrenia, v diagnostike významných patogénov zvierat aj patogénov so zoonotickým potenciálom. Študenti získajú celkový prehľad o charakteristických biologických vlastnostiach jednotlivých mikroorganizmov.

Špeciálna bakteriológia a mykológia (klasifikácia, charakterizácia biologických vlastností a diagnostika potenciálne patogénnych a patogénnych baktérií a plesní).

Špeciálna virológia (klasifikácia, charakterizácia morfologických a patogenetických vlastností a diagnostika vírusov vyvolávajúcich choroby zvierat a človeka).

Prednášky

1. Aeróbne Gram-negatívne koky a tyčinky (Čeľaď: Pseudomonadaceae, Burkholderiaceae, Neisseriaceae, Legionellaceae, Brucellaceae, Francisellaceae, Alcaligenaceae).

2. Čeľaď Enterobacteriaceae (Rody Escherichia, Salmonella, Shigella, Yersinia, Klebsiella, Proteus) vo vzťahu k infekcii alimentárneho pôvodu.

3. Čeľaď Pasteurellaceae. Ostatné fermentatívne, oxidáza pozitívne baktérie (Čeľaď Vibrionaceae, Aeromonadaceae).

4. Rad Spirochetales. Infekcie vyvolané spirochétami, kampylobaktermi a helikobaktermi.

5. Gram-pozitívne koky. Zástupcovia čeľadí Staphylococcaceae a Streptococcaceae. Enzýmy a toxíny v patogenéze stafylokokových a streptokokových infekcií.

6. Gram-pozitívne sporulujúce tyčinky. Čeľaď Bacillaceae, rod Bacillus, rod Clostridium).

7. Gram-pozitívne spóru netvoriace tyčinky (Čeľaď Listeriaceae, Erysipelotrichaceae).

8. Gram-pozitívne tyčinkovité baktérie s osobitným zložením bunkovej steny alebo

mycélium tvoriace baktérie (Mycobacteriaceae, Corynebacteriaceae, Actinomycetaceae, Dermatophytaceae, Nocardiaceae, Brevibacteriaceae).

9. Plesne, mykotoxikózy.

10. Baktérie bez bunkovej steny (Čeľaď Mycoplasmataceae). Obligátne intracelulárne parazity (Rad Rickettsiales, Chlamydiales).

11. DNA vírusy – pôvodcovia chorôb zvierat, klasifikácia a charakteristika.

12. RNA vírusy – pôvodcovia chorôb zvierat, klasifikácia a charakteristika.

13. Prióny – pôvodcovia chorôb zvierat, klasifikácia a charakteristika.

Cvičenia:

1. Diagnostika zástupcov rodu Pseudomonas a Burkholderia

2. Diagnostika Escherichia coli

3. Diagnostika zástupcov rodu Salmonella

4. Diagnostika ostatných významných zástupcov z čeľade Enterobacteriaceae

5. Diagnostika bakteriálnych pôvodcov respiračných ochorení zvierat zástupcov rodu Haemophilus, Pasteurella a Actinobacillus

6. Diagnostika pôvodcov latentne prebiehajúcich a selektívne sa farbiacich bakteriálnych zoonóz (rody Brucella a Mycobacterium), 1. KREDITOVÝ TEST

7. Diagnostika zástupcov rodu Staphylococcus

8. Diagnostika zástupcov rodu Streptococcus

9. Diferenciálna diagnostika zástupcov rodu Bacillus

10. Diagnostika zástupcov rodov Listeria a Rhodococcus

11. Diagnostika bakteriálnych patogénov – samostatná práca

12. Virologická diagnostika, bunkové kultúry, 2. KREDITOVÝ TEST

13. Základné metódy využívané vo virologickej diagnostike

Základná študijná literatúra:

1. Votava M. a kol.: Lékařská mikrobiologie obecná, Praha, 2002.

2. Votava M.: Lékařská mikrobiologie speciální, Centa Brno, 2003.

3. Rajčáni J., Čiampor F.: Lekárska virológia, Veda Bratislava, 2006.

4. Pistl J. a kol.: Veterinárna virológia. Košice, 2013.

5. Pilipčinec E. a kol.: Praktické cvičenia z mikrobiológie, Košice, 2016.

6. Pilipčinec E. a kol.: Špeciálna bakteriológia. Gram-negatívne baktérie. UVLF v Košiciach, 2018.

7. Pilipčinec E. a kol.: Špeciálna bakteriológia. Gram-pozitívne baktérie. UVLF v Košiciach, 2019.

8. Prednášky – aktualizované témy.

Odporúčaná študijná literatúra:

1. Bednář a kol.: Lékářská mikrobiologie. Marvil, 1996.

2. J. Grones: Molekulárna biológia PF-UK Bratislava,1998.

3. Rosypal S.: Úvod do molekulárnej biológie. I.-IV. diel, Brno, 1999-2002.

4. Markey, B. et al.: Clinical Veterinary Microbiology, Mosby Elsevier, 2013.

5. Quinn, P. J. et al.: Veterinary Microbiology and Microbial Disease, Wiley-Blackwell, 2013.

6. McVey, D. S. et al.: Veterinary Microbiology, Wiley-Blackwell, 2013.

7. MacLachlan N. J. and Dubovi E. J.: Fenner´s Veterinary virology, 4th edit. Elsevier Inc., 2011.

Obsahová prerekvizita:

Podmieňujúce predmety:

Chémia, Biológia, Latinská terminológia

Priebežné hodnotenie:

100 % aktívna účasť na cvičeniach, 2 x kreditový test (min. 5,5 bodov, max. 10 bodov/test). Po splnení podmienok študent získava zápočet za daný predmet.

Podmienky na absolvovanie predmetu:

Podmienkami pre absolvovanie predmetu Mikrobiológia v ZS je 100 % aktívna účasťna praktických cvičeniach z mikrobiológie a 2 písomné previerky (testy), s maximom získaných bodov 10/test. Kredit nebude udelený študentovi, ktorý z niektorej písomnej previerky (testu) dosiahne menej ako 5,5 bodov. Predmet končí skúškou pozostávajúcou z 2 častí: praktickej a písomnej. Hodnotenie: kreditové testy 10-20 %, praktická skúška 11-20 %, písomná časť 30-60 %.

V prípade potreby presunutia výučby do online priestoru prostredníctvom platformy MOODLE, môžu nastať zmeny v počte či charaktere otázok, ale základnou podmienkou je dosiahnuť minimálne 51 %.

Záverečné hodnotenie:

Záverečné hodnotenie je formou skúšky, ktorá pozostáva z praktickej a písomnej časti. Praktická časť je zameraná na samostatnú diagnostickú prácu a je hodnotená počtom bodov (11-20). Po úspešnom absolvovaní praktickej skúšky nasleduje písomný test. Ten je rozdelený do 3 častí: všeobecná mikrobiológia, špeciálna bakteriológia a virológia. Záverečná známka je súčtom bodov získaných za zápočet (za obidva semestre), za praktickú a písomnú skúšku.

Študenti majú počas semestra možnosť využívať konzultácie, každý štvrtok od 14.00 - 15.00 hodiny.

Odporúčame využívať platformu Moodle, kde sú uverejnené v pdf formáte prezentácie z prednášok aj praktických cvičení. Rovnako odporúčame využívať online formu štúdia prostredníctvom MS Teams.