Pre absolvovanie predmetu študent musí mať aktívnu účasť na prednáškach a praktickej výučbe. Podmienkou absolvovania skúšky je vypracovanie a obhajoba seminárnej práce na tému zadanú garantom (v rozsahu A-E), ktorá je výsledkom samoštúdia. Skúška je udelená na základe hodnotenia získaných vedomostí (v rozsahu A-E).

Absolvovaním predmetu študent využije vedomosti z epizootológie a zároveň pochopí vzájomné vzťahy klasickej epizootológie a molekulárnej epizotológie, nadobudne nové poznatky o využití metód molekulárnej epizootológie pre štúdium infekčných chorôb zvierat v 21. storočí. Získa nové zručnosti na identifikáciu a typizáciu patogénov na úrovni genómu mikroorganizmov. Získa skúsenosti s využitím bioinformatických metód na skúmanie genetickej variability patogénov, s používaním medzinárodných databáz, čo mu umožní determinovať vzťahy medzi patogénmi v ohnisku nákazy aj vzťahy medzi ohniskami nákazy. So získanými poznatkami a vedomosťami z molekulárnej epizootológie dokáže absolvent samostatne interpretovať výsledky, formulovať správne závery a odporúčania pre zdolávanie a riešenie nákazových situácií v chovoch zvierat v súlade s modernými prístupmi porovnateľnými s vyspelými krajinami sveta.

Základné princípy a postupy molekulárnej epizootológie; Vzťahy medzi klasickou epizootológiou a molekulárnou epizotológiou; Identifikácia patogénneho mikroorganizmu – pôvodcu nákazy, prípadne zoonózy na úrovni genómu, potvrdenie ohniska nákazy molekulárno-genetickými metódami; Genóm patogénneho mikroorganizmu, mutácie DNA, význam mutácií; Analýza mutácií DNA v ohnisku nákazy bioinformatickými metódami; Molekulárne dáta, ich vzájomné porovnávanie (alignment nukleotidových sekvencií) a porovnávanie s dátami medzinárodných databáz (NCBI, EMBL); Význam porovnávania molekulárnych dát pre určenie vzťahov medzi ohniskami nákazy; Význam metód molekulárnej epizootológie pre zdolávanie nákaz, pre realizáciu ozdravovacích programov v chovoch hospodárskych zvierat.

Šmarda J., Doškař J., Pantůček R., Růžičková V., Koptíková J.: Metódy molekulární biologie, Masarykova univerzita v Brně, 2005, 188 s. ISBN 80-210-3841-1

Krebs J.E., Goldstein E.S., Kilpatrick S.T.: Lewin's Genes XI, Jones & Bartlett Publishers, 2014, 930 pp. ISBN 1449659853

Krebs J.E., Goldstein E.S., Kilpatrick S.T.: Lewin's Essential Genes, Jones & Bartlett Learning, 2021, 1044 pp. ISBN 9781284173130

Sambrook J., Fritsch E. F., Maniatis T.: Molecular Cloning: A Laboratory Manual 1-3. 2nd edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 1989, 1626 pp. ISBN 0-87969-309-6

Lee H., Morse S., Olsvik Ø.: Nucleic Acid Amplification Technologies: Application to Disease Diagnosis. Eaton Publishing, 1997, 286 pp. ISBN 1-881299-04-X

Higgins D., Taylor W.: Bioinformatics: Sequence, structure and databanks. Oxford University Press, 2000, 249 pp. ISBN 0-19-963791-1

Vilček Š., Jacková A., Vlasáková M.: Využitie molekulovogenetických metód v epizootológii, UVLF Košice, 2013, 70 s. ISBN 978-80-8077-383-0

Priebežné hodnotenie:

Vypracovanie seminárnej práce

Podmienky na absolvovanie predmetu:

Pre absolvovanie predmetu študent musí mať aktívnu účasť na prednáškach a praktickej výučbe. Podmienkou absolvovania skúšky je vypracovanie a obhajoba seminárnej práce na tému zadanú garantom (v rozsahu A-E), ktorá je výsledkom samoštúdia. Skúška je udelená na základe hodnotenia získaných vedomostí (v rozsahu A-E).

Záverečné hodnotenie:

Skúška