Podmienkou pre absolvovanie predmetu a udelenie zápočtu je 100 % aktívna účasťna praktických cvičeniach z mikrobiológie.V priebehu semestra študenti absolvujú 2 písomné previerky (kreditové testy), s maximom získaných bodov 10/test. Kreditové testy sa píšu spravidla v 6. a 12. týždni semestra. Kredit nebude udelený študentovi, ktorý z niektorej písomnej previerky (kreditového testu) dosiahne menej ako 5,5 bodu. Predmet je ukončený skúškou, ktorá pozostáva z praktickej (ústnej odpovede) a teoretickej časti (testu). V prípade presunutia výučby do online priestoru prostredníctvom platformy MOODLE môžu nastať zmeny v počte či charaktere otázok v teste , ale základnou podmienkou je dosiahnuť minimálne 51 %.

Po absolvovaní predmetu Mikrobiológia študenti získajú vedomosti zo špeciálnej bakteriológie a virológie, s ohľadom na taxonomické zatriedenie, faktory patogenity a patogenézu infekcií a zároveň získajú prehľad o uplatnení vyšetrovacích metód akými sú mikroskopické, kultivačné alebo biochemické a sérologické vyšetrenie, v diagnostike významných patogénov.

Špeciálna časť je zameraná na detekciu a charakterizáciu najmä patogénnych mikroorganizmov: ich systematické zatriedenie; definovanie charakteristických vlastnosti (faktory patogenity, rastové podmienky, biochemické a antigénne vlastnosti, cesty prenosu), úloha a význam v patogenéze ochorení. Osobitný zreteľ je kladený na mikroorganizmy ovplyvňujúce kvalitu potravín.

Prednášky:

1. Šprirálovité baktérie (čeľaď Brachyspiraceae, Leptospiraceae, Borreliaceae a Spirochaetaceae).

2. Gram-negatívne, aeróbne alebo mikroaerofilné, pohyblivé, zakrivené až špirálovité baktérie

(čeľaď Spirillaceae, Campylobacteraceae a Helicobacteraceae).

3. Gram-negatívne, aeróbne alebo mikroaerofilné tyčinky a koky (čeľaď Bartonellaceae,

Brucellaceae, Alcaligenaceae, Burkholderiaceae a Neisseriaceae).

4. Gram-negatívne, aeróbne alebo mikroaerofilné tyčinky a koky (čeľaď Legionellaceae,

Moraxellaceae, Pseudomonadaceae, Francisellaceae a Flavobacteriaceae).

5. Gram-negatívne, fakultatívne anaeróbne tyčinky (čeľaď Aeromonadaceae, Enterobacteriaceae,

Pasteurellaceae a Vibrionaceae)

6. Zástupcovia radu Rickettsiales (čeľaď Anaplasmataceae a Rickettsiaceae) a radu Legionellales

(čeľaď Coxiellaceae).

7. Zástupcovia radu Chlamydiales (čeľaď Chlamydiaceae a Parachlamydiaceae).

8. Gram-pozitívne, aerobné a fakultatívne anaeróbne koky (čeľaď Micrococcaceae,

Staphylococcaceae, Enterococcaceae a Streptococcaceae).

9. Gram-pozitívne, aeróbne a anaeróbne, spóru tvoriace tyčinky (čeľaď Bacillaceae,

Paenibacillaceae, Clostridiaceae a Peptostreptococcaceae).

10. Gram-pozitívne, aerobné a fakultatívne anaeróbne spóru netvoriace tyčinky a vlákna (čeľaď

Listeriaceae, Erysipelotrichaceae, Actinomycetaceae a Eubacteriaceae).

11. Mykobaktérie (čeľaď Mycobacteriaceae) a mykoplazmy (trieda Mollicutes).

12. DNA vírusy – pôvodcovia chorôb zvierat, klasifikácia a charakteristika.

13. RNA vírusy a prióny – pôvodcovia chorôb zvierat, klasifikácia a charakteristika.

Cvičenia:

1. Diagnostika zástupcov rodu Pseudomonas a Burkholderia.

2. Diagnostika zástupcov rodu Escherichia (E. coli).

3. Diagnostika zástupcov rodu Salmonella.

4. Diagnostika ostatných významných zástupcov z čeľade Enterobacteriaceae.

5. Diagnostika bakteriálnych pôvodcov respiračných ochorení zvierat zástupcov rodu

Haemophilus, Pasteurella a Actinobacillus.

6. Diagnostika pôvodcov latentne prebiehajúcich a selektívne sa farbiacich bakteriálnych zoonóz.

1. KREDITOVÝ TEST.

7. Diagnostika zástupcov rodu Staphylococcus.

8. Diagnostika zástupcov rodov Streptococcus a Enterococcus.

9. Diferenciálna diagnostika zástupcov rodu Bacillus.

10. Diagnostika zástupcov rodov Listeria a Rhodococcus.

11. Diagnostika bakteriálnych patogénov – samostatná práca.

12. Zásady virologickej diagnostiky. 2. KREDITOVÝ TEST.

13. Základné metódy vo virologickej diagnostike a hodnotenie práce študentov na praktických

cvičeniach.

Základná študijná literatúra

1. Pilipčinec E. a kol.: Špeciálna bakteriológia. Gram-negatívne baktérie. UVLF v Košiciach, 2018.

2. Pistl J. a kol.: Veterinárna virológia. Košice, 2013.

3. Pilipčinec E. a kol.: Praktické cvičenia z mikrobiológie. UVLF v Košiciach, 2016.

4. Pilipčinec E. a kol.: Špeciálna bakteriológia Gram-negatívne baktérie. UVLF v Košiciach, 2018.

5. Pilipčinec E. a kol.: Špeciálna bakteriológia Gram-pozitívne baktérie. UVLF v Košiciach, 2019.

6. Votava M. a kol.: Lékařská mikrobiologie obecná, Praha, 2002.

7. Votava M.: Lékařská mikrobiologie speciální, Centa Brno, 2003.

8. Prednášky – aktualizované témy.

Odporúčaná študijná literatúra:

1. Markey, B. et al.: Clinical Veterinary Microbiology, Mosby Elsevier, 2013.

2. Quinn, P. J. et al.: Veterinary Microbiology and Microbial Disease, Wiley-Blackwell, 2013.

3. McVey, D. S. et al.: Veterinary Microbiology, Wiley-Blackwell, 2013.

Obsahová prerekvizita:

Podmieňujúce predmety: Chémia, Biológia, Latinská terminológia

Priebežné hodnotenie:

Naplnenie cieľov praktických cvičení a výsledkov 2 kreditových testov (min. 5,5 bodov, max. 10 bodov/test) realizovaných počas semestra a 100 % aktívna účasť na praktických cvičeniach z mikrobiológie.

Podmienky na absolvovanie predmetu:

Podmienkou pre absolvovanie predmetu a udelenie zápočtu je 100 % aktívna účasťna praktických cvičeniach z mikrobiológie.V priebehu semestra študenti absolvujú 2 písomné previerky (kreditové testy), s maximom získaných bodov 10/test. Kreditové testy sa píšu spravidla v 6. a 12. týždni semestra. Kredit nebude udelený študentovi, ktorý z niektorej písomnej previerky (kreditového testu) dosiahne menej ako 5,5 bodu. Predmet je ukončený skúškou, ktorá pozostáva z praktickej (ústnej odpovede) a teoretickej časti (testu). V prípade presunutia výučby do online priestoru prostredníctvom platformy MOODLE môžu nastať zmeny v počte či charaktere otázok v teste , ale základnou podmienkou je dosiahnuť minimálne 51 %.

Záverečné hodnotenie:

Zápočet (min. 10 % a max. 20 %), praktická skúška - ústna odpoveď (min. 11 % a max. 20 %), písomná skúška - test pozostávajúci z 3 častí: všeobecná mikrobiológia, špeciálna bakteriológia a špeciálna virológia (min. 30 % a max. 60 %). Podmienkou písania testu je úspešné absolvovanie praktickej skúšky.

Študenti majú počas semestra možnosť využívať konzultácie, každý štvrtok od 14.00 - 15.00 hodiny.

Odporúčame využívať platformu Moodle, kde sú uverejnené v pdf formáte prezentácie z prednášok aj praktických cvičení. Rovnako odporúčame využívať online formu konzultácií prostredníctvom MS Teams.